Toutes les nouvelles religions à leurs débuts ont dû faire face à des vicissitudes avant de se faire accepter. Il en a été de même pour la Scientologie. Mais à mesure que l'Église prenait de l'importance et devenait de plus en plus visible, elle était davantage acceptée et comprise. Aujourd'hui, le caractère religieux de la Scientologie est totalement reconnu par des tribunaux et des gouvernements du monde entier.

Les tribunaux des États-Unis ont toujours soutenu que la Scientologie était une religion ; en effet, dans un décret de la Cour d'appel fédérale de septembre 1993, les juges ont déclaré qu'aucun tribunal des États-Unis n'avait décidé du contraire.

La plus importante des reconnaissances officielles de la religion de Scientologie s'est produite en octobre 1993, lorsque le fisc américain a reconnu à part entière le caractère religieux de toutes les Églises de Scientologie et de leurs organisations d'amélioration sociale, et il a conclu, après une revue complète et approfondie, que les Églises de Scientologie étaient établies et œuvraient exclusivement à des fins religieuses et caritatives. Le fisc américain a aussi déterminé que la Scientologie était une religion authentique répondant aux critères détaillés du fisc américain et méritait le titre d'« Église ».

L'enquête du fisc américain ne s'est pas limitée aux États-Unis, mais incluait expressément une vérification de la comptabilité et des activités des organisations de l'Église, de l'Australie à l'Europe. Sa décision a été unanime : les Églises de Scientologie œuvraient dans l'intérêt de la société.

Les gouvernements européens ont depuis lors accordé des reconnaissances religieuses et d'utilité publique similaires à d'autres Églises de Scientologie. Souvent, ces reconnaissances étaient précédées par des décisions de justice.

Dès 1980, la Cour d'appel de Paris a décrété qu'il fallait protéger les droits de la Scientologie en tant que religion, conformément à la Constitution française et à la Convention européenne des droits de l'homme. Cette décision a été soutenue plus tard par la Cour d'appel de Lyon¹.

En 1997, l'Église de Scientologie de Milan a gagné un procès qui, selon les experts, constitue un précédent juridique européen majeur dans le domaine de la religion. La Cour suprême italienne a rejeté la décision d'une juridiction inférieure qui avait retenu une définition essentiellement judéo-chrétienne du mot religion, et elle a fait remarquer que cela excluait le taoïsme, le bouddhisme et bien d'autres grandes religions. La cour a expliqué de façon détaillée la raison pour laquelle la Scientologie méritait d'être considérée comme une religion, décision adoptée par le ministre des Finances italien qui, peu après, exonérait d'impôts les Églises de Scientologie d'Italie.

Quelques semaines plus tard seulement, la Cour fédérale administrative allemande estimait que les pratiques religieuses de la Scientologie étaient un « conseil spirituel » destiné à « amener l'individu à des états d'être plus élevés ». La Cour administrative et la Cour d'appel allemandes ont jugé dans plus de 40 procès que la religion de Scientologie devait recevoir la protection de l'Article 4 de la constitution allemande, qui garantit le droit à la croyance et aux pratiques religieuses, et à une idéologie.

En novembre 1999, le gouvernement suédois a déclaré que l'Église de Scientologie était une association caritative à but non lucratif et à caractère religieux. De plus, l'année suivante, le gouvernement suédois a officiellement confirmé la reconnaissance de l'Église en accordant à ses ministres le droit de célébrer légalement des mariages.

1. La décision de la Cour d'appel de Lyon du 28 juillet 1997 déclare : « L'Église de Scientologie a le droit de revendiquer son statut religieux et d'accroître en toute liberté, dans le cadre des lois existantes, ses activités et les activités de ses missionnaires, et a également le droit de faire du prosélytisme. »